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来源:大发平台下载2024-08-16 17:48

  

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提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

  近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。

  全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

  统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

  相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

  该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

  与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。

  该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

 

重庆上线电商平台防疫药物保障专区 保障市民用药等需求******

  (抗击新冠肺炎)重庆上线电商平台防疫药物保障专区 保障市民用药等需求

  中新网重庆12月26日电 (记者刘相琳)记者26日从重庆市商务委获悉,为保障市民用药和防护物资需求,在重庆市商务委、市经信委的指导协调下,重庆联合阿里、京东、美团紧急上线“重庆防疫药物保障专区”,为重庆市民定向供应散列通、抗原检测试剂等紧缺药品及防护物资。

  据介绍,三大平台将本着保障供应强度、控制售价的惠民原则,向市民销售平价防疫物资,如某品牌抗原试剂,各平台统一零售价一盒79元(20人份)。同时,平台还提供线上24小时极速问诊、在线购药和健康科普等服务,保障市民正确用药。

  市民进入淘宝、京东、美团外卖任一电商平台首页,直接搜索“重庆防疫”,即可进入专区。为使本轮投放的药物能够尽量多覆盖重庆有需求的消费者,各平台对紧缺物资进行了限量销售,订单送达地址仅限重庆市内,有需要的市民可在每天10点、20点进入专区选购。

  重庆市商务委相关负责人介绍,重庆充分借鉴天津、河南等地经验做法,广泛调集线上平台参与,以阿里、京东、美团等企业为重点保障渠道,发动和平药房、桐君阁等连锁药房的线上商城,共同参与医药流通保供形成合力;对平台分类部署细化流程,开辟重庆专区,鼓励线下药房快速上线,并提供专业咨询,完善问诊配全流程;多措并举保障货足价稳,加强产销对接增强货源储备,全力保障配送运力,精细化投放与实行价格管控,竭力保障市民便捷、快速地购买安心平价的医药物资。(完)

  (文图:赵筱尘 巫邓炎)

[责编:天天中]
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